変化を伴う由来　Descent with modification
ダーウィンが「種の起原」で示した「進化」の同義語　-p17
　
進化的思考　Evolutionary thinking
進化的にものを考えることで、それまで説明のつかなかったことが一幅の絵のように整然とした論になる。　-p18
　
系統樹思考
--何か相互に由来関係があるのではないか、という問いかけ　-p24
　
多様性を「系譜」という観点で理解しようとすること　-p37
　
科学的であるかどうかは、個々の科学研究分野の特性や制約の中で、いかにして仮説や主張を経験的にテストできるかどうかに主眼がおかれるべき。　-p45
　
普遍法則を求める科学が「タイプ」について論議してきたのに対し、歴史や進化を論じる科学は「トークン」に関する考察をしていると言ってもかまわない　-p75
　
分類は絶対的なものではなく、ある採用された分類基準（類似性の尺度）にしたがってグループ分けをしているに過ぎない。　-p
　
系統樹を描くということは、多様な対象物に関する鳥瞰図を与えると同時に（略）相互比較のための足場を組み立て、そのような多様性が生じた因果に関する推類を可能にし、さらには対象物に関するさまざまな地検を体系化し、整理するという役割も担っている。　-p164
　
「系統樹の世界」